本书以生物学问题为导向，以具体的案例来演示如何用信息学方法处理各种生物学数据，并对目前研究中存在的问题和未来的发展方向进行了展望。全书从介绍生物信息学的研究历史和发展现状入手，第2章描述了相关生物学基础，重点讨论生物信息学的研究对象——生物大分子；第3章介绍了生物数据的常用分析算法，包括统计分析、机器学习和模型评估方法，并新增了一些算法介绍，特别是新近发展的随机森林和深度学习方法；从第4章开始，分专题介绍了各种组学研究，包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、生物网络和系统生物学。最后，作为案例，本

    生物信息学是运用生物学、数学、计算机科学等多学科技术与手段进行生物信息的获取、贮存、分析、利用的一门交叉学科，是目前生物学研究热门领域之一。本书内容包括两个篇章：一是Windows系统下进行文献检索、数据库使用、引物设计、核酸蛋白质序列分析、进化分析、蛋白质结构分析、miRNA分析等理论与方法及相关软件使用介绍；二是linux系统下面对于基因组测序、RNAseq、miRNAseq等二代测序数据组装、基因预测、注释、表达分析等操作流程及相关软件介绍。

本书介绍生物信息学平台搭建和常用基础软件的安装与运行，使读者能够配置自己的生物信息学分析环境；通过介绍计算机辅助药物设计和基因组重复序列分析等内容使读者熟悉生物信息学分析的一般策略。着重讲解生物信息学分析过程中常见问题的解决方法，在确保操作步骤完整的基础上尽量精简，力求帮助使读者在*短的时间内掌握知识和能胜任该方面工作。

当前生物信息学研究重点是对基因组序列、蛋白质组学和数组技术所产生的大量数据的计算分析。本书对DNA、RNA和蛋白质数据的计算提供了丰富的演算方法，并指出了在解决生物学问题中这些方法的优缺点及应用策略。
　　本书的**版是在Mount博士讲稿的基础上进行整理出版的，在全球范围内用作教材。第二版对内容进行了全面的修订，由专业教师提供导读，*程度地适用本科生和研究生教学。?
　　本书为高等院校生物信息学专业本科生和研究生提供理想的学习材料。同时，本书也适宜科研人员、信息专家自学使用。

    本书实例意在解决生物学问题，通过“编程技法”的形式，涵盖尽可能多的组织、分析、表现结果的策略。在每章结尾都会有为生物研究者设计的编程题目，适合教学和自学。本书由六部分组成：Python语言基本介绍，语言所有成分介绍，高级编程，数据可视化，生物信息通用包Biopython，最后给出20个编程秘笈，范围涵盖了从二级结构预测、多序列比对到蛋白质三维结构的广泛话题。此外，本书附录还包括了大量的生物信息常用资源的信息。

　　《生物信息学基础教程》根据两位作者张洛欣、马斌多年的教学与科研经验创作而成，兼顾学科基础和研究前沿。全书

　　《生物信息学 基础及应用》简要介绍生物信息学的发展历史、主要研究领域及应用前景，并重点讲述生物信息学的基本知识点和基本技术、方法，生物分子信息数据库的类型及应用，复杂疾病的生物信息学研究思路、方法和典型应用实例。每个知识单元均包括生物信息学基础知识点、应用生物信