生物信息学是一门应用性很强的学科,编者在多年从事生物信息学教学的基础上,根据生物学研究者最常见的需求或问题,设计了10个基础实验,目的是加深初学者对理论知识的理解,包括分子序列数据库、BLAST搜索、多序列联配、系统发生树构建、序列拼接与基因预测、基因组可视化、蛋白质功能域及结构预测、非编码microRNA鉴定及其靶标预测、转录组分析、Python基础及利用Python提取序列。这10个实验在个人电脑上即可完成,全部是通过在线服务或Windows版软件来实现,从而方便操作。
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目录
实验1 分子序列数据库记录格式与检索 001
实验2 数据库序列搜索 013
实验3 多序列联配 025
实验4 系统发生树构建 036
实验5 序列拼接与基因预测 048
实验6 基因组可视化 059
实验7 蛋白质功能域及结构预测 070
实验8 非编码microRNA鉴定及其靶标预测 082
实验9 转录组分析 095
实验10 Python基础及利用Python提取序列 107
主要参考文献 118
本书示范案例中使用的主要数据库 121