本书针对从事医学图像处理领域工作的学生培养以及医学图像处理研究的实际需要,结合作者多年来积累的研究成果,全面系统地介绍了医学图像处理相关技术及其在医学临床诊断和治疗中的应用。全书共10章,主要内容包括绪论、医学影像图像获取、医学图像预处理、医学图像分割、医学图像配准、医学图像融合、医学图像三维重建、医学图像处理在放射治疗中的应用、基于DICOM标准的PACS系统、医学图像处理与分析软件平台。
本书内容系统、新颖,图文并茂,理论与实践并重。本书可作为高等院校生物医学工程、计算机应用、医学影像学、模式识别等专业的高年级本科生与研究生教材,也可供相关领域的科研人员和工程技术人员参考。
随着信息技术及医学影像成像技术的发展,医学图像处理在医学临床、教学和科研中发挥着越来越重要的作用,有力地推动着医学科学研究和临床医疗的进步。目前,各医院大量地应用超声成像、计算机断层扫描成像、核磁共振成像、正电子发射断层显像、单光电子发射断层显像等医学影像对患者的病情进行分析和诊断,为患者制定合理的治疗计划并引导精确治疗。如何有效地应用图像增强、分割、配准、融合以及三维重建等数字图像分析与处理技术,对人体解剖结构和病变区域进行定位、提取、三维再现并量化分析是使得医学影像数据应用价值最大化的前提和保证。
本书作者所在科研团队主要在医学图像处理算法及其相关领域进行教学及科学研究工作,查阅了大量国内外相关文献资料,提出或改进了一系列的医学图像处理算法,并应用这些算法开发了基于医学图像处理的放疗计划软件系统。作者根据多年的教学以及项目研发经验,认为很有必要为相关专业高年级本科生、研究生以及专业人员编写一本教材,包含医学影像处理领域中关键技术的基本原理、国内外最新主要成果,并充分将理论与实践相结合,展现医学图像处理理论的实际应用,同时向读者介绍目前国内外功能比较强大的医学图像处理和分析软件平台及其各自特点,提供查找其相应资料的网址,以指导读者能够根据自己在某一方面的需求进行相应的深入学习、研究及应用。
本书共分10章。第1章绪论,重点介绍图像和医学图像的基本概念、医学图像处理的主要研究内容、医学图像处理的典型应用和重要意义。第2章医学影像图像获取,介绍医学影像的多种成像模式,并讨论医学影像文件格式以及与图像其他格式的相互转换问题。第3章医学图像预处理,介绍医学图像的滤波、增强以及插值方法,并对医学图像的窗宽窗位调整以及图像的伪彩显示进行阐述。第4章医学图像分割,介绍医学图像的自动分割及交互式分割,并讨论对图像分割评价的准则和标准。第5章医学图像配准,介绍医学图像配准的关键技术和常用的医学图像配准方法,并重点介绍基于归一化互信息的多模态医学图像配准、基于有限元方法的医学图像非刚性配准和基于多分辨率策略的医学图像配准,最后介绍图像配准的评价指标和方法。第6章医学图像融合,医学图像融合是利用多种医学影像模式对患者病情进行分析及判断的基础,本章重点介绍基于塔形分解和基于小波变换的两种医学图像融合方法,并从客观和主观两个方面对医学图像融合的评价指标进行分析。第7章医学图像三维重建,首先介绍医学图像三维重建的基本概念和流程,然后采用面绘制和体绘制两种绘制方法讲述医学图像三维重建算法,最后重点介绍移动立方体、光线投射以及基于GPU的医学图像三维重建算法。第8章介绍医学图像处理在放射治疗中的应用,在对放射治疗及放疗计划系统进行介绍的基础上,重点分析讨论了基于医学图像处理的放疗计划软件系统。第9章基于DICOM标准的PACS系统,在介绍数字医学图像DICOM标准的基础上,重点阐述PACS的基本组成、应用、软件体系结构以及涉及的关键技术。第10章医学图像处理与分析软件平台,介绍医学图像处理和分析中常用的国内外算法工具包ITK、VTK、MITK和IGSTK,并对目前国内外主要的医学影像处理与分析软件进行了介绍。
本书的相关研究工作得到了兰州交通大学电信学院、中国科学院近代物理研究所、兰州军区兰州总医院的大力支持,在此表示感谢; 同时感谢杨艳春博士、孙滕、刘云武、杨旭、肖孟强、安绿波、杭利华、郭嫽等硕士为本书编写收集了很多资料,并做了认真的校对工作。
本书的编写得到了国家自然科学基金“图像引导重离子放疗中靶区的精确定位及剂量校正方法研究(61162016)”、“重离子放疗计划系统中基于医学图像处理的若干关键问题研究(60962004)”、甘肃省科技支撑计划项目“图像引导的重离子放疗计划系统研发及集成(1104FKCA102)”以及2011年度“陇原青年创新人才扶持计划”等项目的资助; 本书参考了国内外的大量书籍、论文以及相关软件平台网站,在此对所有引用文献的作者表示由衷的感谢!
限于作者水平,书中难免存在不足之处,恳请广大读者在阅读过程中对本书提出宝贵意见,进行批评指正!
作者
2012年1月
第1章绪论
1.1医学影像图像
1.2医学图像处理的主要研究内容
1.2.1医学图像数据获取
1.2.2医学图像预处理技术
1.2.3医学图像分割
1.2.4医学图像配准
1.2.5医学图像融合
1.2.6医学图像三维重建
1.2.7DICOM标准
1.2.8PACS系统
1.2.9图像引导手术及放疗计划制定
1.3医学图像处理的意义及应用
1.3.1医学图像处理的意义
1.3.2医学图像处理的应用
1.4本章小结
第2章医学影像图像获取
2.1医学影像成像模式
2.2X线成像
2.2.1X线机的构成和分类
2.2.2X线成像的基本原理
2.2.3X线诊断的新进展
2.3CT成像
2.3.1CT设备的基本结构及发展历史
2.3.2CT成像的基本概念
2.3.3CT成像的基本原理和特点
2.3.4螺旋CT
2.4超声成像
2.4.1超声成像的基本原理
2.4.2几种超声诊断仪的成像特点
2.5核磁共振成像
2.5.1核磁共振成像的基本原理
2.5.2核磁共振成像的特点
2.5.3核磁共振成像的临床应用和局限性
2.5.4核磁共振设备的基本结构
2.6发射型计算机断层成像
2.6.1单光子发射型计算机断层(SPECT)设备
2.6.2正电子发射型计算机断层(PET)设备
2.7医学影像文件格式及其相互转换
2.7.1医学影像文件格式
2.7.2医学影像文件格式转换
2.8本章小结
第3章医学图像预处理
3.1医学图像噪声去除
3.1.1图像噪声
3.1.2图像均值滤波算法
3.1.3图像中值滤波算法
3.1.4K近邻平滑(均值、中值)滤波方法
3.1.5高斯平滑滤波方法
3.2医学图像增强
3.2.1医学图像的对比度增强
3.2.2医学图像减影技术
3.2.3直方图均衡化方法
3.2.4医学图像伪彩色处理
3.3医学图像插值
3.3.1最近邻插值
3.3.2均值插值
3.3.3双线性插值
3.3.4双三次插值
3.3.5分形插值
3.4窗宽、窗位调整
3.4.1窗口技术
3.4.2调窗处理
3.5本章小结
第4章医学图像分割
4.1医学图像分割概述
4.1.1图像分割原理
4.1.2图像分割算法分类
4.1.3医学图像分割任务及临床应用
4.1.4医学图像分割的研究特点
4.2基于区域的分割方法
4.2.1阈值分割法
4.2.2区域生长法
4.2.3区域分裂合并法
4.2.4聚类分割法
4.3基于边界的分割方法
4.3.1微分算子法
4.3.2曲面拟合法
4.3.3串行边界查找
4.4基于特定理论的分割
4.4.1基于模糊集理论的方法
4.4.2基于统计学的方法
4.4.3基于人工智能算法的分割方法
4.4.4基于小波变换的分割方法
4.5分水岭分割算法
4.5.1分水岭算法概述
4.5.2分水岭算法原理
4.5.3分水岭算法在医学图像中的运用
4.6水平集分割算法
4.6.1曲线演化理论
4.6.2水平集分割模型
4.6.3水平集分割算法流程
4.7Livewire交互式分割算法
4.7.1原理概述
4.7.2LiveWire算法流程
4.8基于Snake模型的交互式分割算法
4.8.1Snake算法的数学模型
4.8.2Snake模型的工作原理
4.8.3改进的Snake算法
4.9序列医学图像分割方法
4.9.1序列图像分割
4.9.2算法原理
4.10图像分割的评价
4.10.1分割评价准则
4.10.2医学图像分割结果的评价
4.11本章小结
第5章医学图像配准
5.1医学图像配准概述
5.1.1图像配准的定义
5.1.2图像配准的分类
5.1.3医学图像配准的临床应用
5.2医学图像配准关键技术
5.2.1图像配准的基本步骤
5.2.2图像配准关键技术
5.3医学图像配准方法
5.3.1基于特征的图像配准
5.3.2基于像素的图像配准
5.3.3医学图像非刚性配准
5.4基于归一化互信息的多模态医学图像配准
5.4.1互信息基础理论
5.4.2互信息配准算法
5.4.3归一化互信息与高阶互信息
5.5基于有限元方法的医学图像非刚性配准
5.5.1图像有限元分析
5.5.2有限元配准理论
5.5.3互信息驱动的有限元配准方法
5.6多分辨率图像配准策略
5.6.1图像多级分解金字塔
5.6.2基于多分辨率策略的图像配准
5.7图像配准评价
5.7.1评价指标
5.7.2评价方法
5.8本章小结
第6章医学图像融合
6.1医学图像融合概述
6.2医学图像融合分类
6.3简单的医学图像融合方法
6.4基于塔形分解的医学图像融合方法
6.4.1基于拉普拉斯金字塔的医学图像融合
6.4.2基于比率金字塔的医学图像融合
6.4.3基于对比度金字塔的医学图像融合
6.4.4基于梯度金字塔的医学图像融合
6.5基于小波变换的医学图像融合方法
6.5.1小波变换的基础理论
6.5.2图像的二维小波分解
6.5.3基于小波变换的医学图像融合
6.6医学图像融合评价指标
6.6.1主观评价指标
6.6.2客观评价指标
6.7本章小结
第7章医学图像三维重建
7.1医学图像三维重建概述
7.1.1基本概念
7.1.2医学图像三维重建流程
7.1.3医学图像三维重建算法分类
7.1.4医学图像三维重建主要应用
7.2医学图像三维重建算法
7.2.1面绘制算法
7.2.2体绘制算法
7.2.3面绘制与体绘制的比较
7.3移动立方体算法
7.3.1移动立方体算法的原理
7.3.2移动立方体算法存在的问题
7.3.3对移动立方体算法的改进
7.4光线投射算法
7.4.1光线投射算法的基本原理
7.4.2光线投射算法流程
7.4.3对光线投射算法的优化
7.5基于GPU的医学图像三维重建算法
7.5.1可编程GPU简介
7.5.2基于GPU的体绘制
7.5.3GPU体绘制算法流程
7.6本章小结
第8章医学图像处理在放射治疗中的应用
8.1放射治疗技术的发展
8.1.1三维适形放疗
8.1.2调强放射治疗
8.1.3图像引导放疗
8.1.4剂量引导放疗
8.1.5自适应放疗
8.2放疗计划系统的软硬件组成
8.2.1放疗计划软件系统
8.2.2直线加速器
8.2.3多叶光栅MLC
8.2.4独立准直器
8.2.5模拟定位机
8.2.6电子射野影像装置EPID
8.2.7锥形束计算机断层扫描技术CBCT
8.2.8平板探测器FPD
8.3基于医学图像处理的放疗计划软件系统
8.3.1放疗计划软件系统概述
8.3.2RTPS中的医学图像处理关键技术
8.3.3系统功能及实施流程
8.3.4系统的各模块功能及实现
8.4本章小结
第9章基于DICOM标准的PACS系统
9.1PACS概述
9.1.1PACS概念的提出
9.1.2PACS的国内外进展
9.1.3PACS的基本构成
9.1.4PACS系统的应用
9.2数字医学图像的DICOM标准
9.2.1DICOM标准发展概述
9.2.2DICOM的总体结构和主要内容
9.2.3DICOM标准中涉及的基本概念和定义
9.2.4DICOM信息模型及数据结构
9.2.5DICOM文件结构和文件解析
9.2.6DICOM的网络通信
9.2.7DICOM标准的意义
9.3PACS的软件体系结构
9.3.1C/S架构
9.3.2B/S架构
9.3.3分布式架构
9.3.4基于CORBA的三层分布式PACS的体系结构
9.4PACS中的关键技术
9.4.1存储技术和数据库技术
9.4.2影像数据获取技术
9.4.3医学影像显示技术
9.4.4医学图像处理与压缩技术
9.4.5系统集成技术
9.5PACS的主要影响因素及发展趋势
9.5.1影响PACS功能和性能的主要因素
9.5.2PACS的发展趋势
9.6本章小结
第10章医学图像处理与分析软件平台
10.1算法工具包
10.1.1医学图像分割与配准工具包ITK
10.1.2可视化工具包VTK
10.1.3集成化医学图像处理与分析算法研发平台MITK
10.1.4图像导航手术工具包IGSTK
10.2国内外医学影像处理与分析软件
10.2.1VolView
10.2.2VGStudio MAX
10.2.33D Doctor
10.2.43D Slicer
10.2.5MedINRIA
10.2.6GIMIAS
10.2.7MeVisLab
10.2.83DMed
10.2.9Medical Imaging Interaction Toolkit
10.3本章小结
参考文献